Peygamber sünnetinin tedavisi cerrahi müdahale ile mümkündür. Bu ameliyatın, cinsel kimliği etkilememesi ve özgüven eksikliklerine yol açmaması için mümkün oldukça erken yapılması gerekir. Bunun için ideal yaş 6-18 ay aralığı olarak belirlenmiştir.
Genellikle 2 yaşından önce ameliyatın yapılmış olması önerilir. Ancak bazı çocuklarda 4-7 yaşına kadar ameliyat yapılabilir. Genellikle önerilen, ilkokul çağına başlamadan önce ameliyat sürecinin tamamlanmış olmasıdır. Bu şekilde çocuğun sosyal yaşama alışma süreci hız kazanır ve ek kişisel gelişim sorunlarının ortaya çıkma riski düşer.
Peygamber sünneti ameliyatında amaç, penisi fiziksel ve işlevsel açıdan normal hale getirmektir. Hastalarda genellikle sünnet derisi, ameliyat sırasında kullanılır. Bu nedenle sünnet öncesi çocuklarda mutlaka uzman muayenesi gerekir. Ameliyat sırasında bölgedeki eksik deri parçaları sünnet derisinden karşılanır ve idrar deliği ile penis yapısının normal hale getirilmesi sağlanır.
Eşlik eden diğer problemler de varsa (inmemiş testis, kasık fıtığı, penis eğriliği (kordi) ve bifid skrotum gibi) aynı seansta tek anestezi ile bu sorunlar da tedavi edilmelidir. Ameliyatta sünnet derisi kullanıldığı için, öncesinde sünnet yaptırmamak önemlidir.
Düzenli doktor muayenesi ve kontrol hastalığın kesin tanısının konulmasında ve gerekiyorsa ameliyat ihtimalinin değerlendirilmesinde etkilidir.
Çocukta var olan sorunun kesin olarak peygamber sünneti olduğu biliniyorsa, sünnet tarihi ertelenmeli ve çocuk mümkün olan en yakın zamanda ameliyat edilmelidir. Bu sayede kişisel ve sosyal gelişim açısından çocukta daha farklı psikolojik problemlerin ortaya çıkması engellenir.
Topluma ve kendine faydalı bireylerin yetiştirilmesi için sorunun mümkün olan en kısa sürede ortadan kaldırılması doğru olur.
